SOFORT ist als eines der sichersten Online-Zahlungssysteme konzipiert. Die Nettoüberweisung erfolgt über das Login-Verfahren der Bank in Verbindung mit einem Bestätigungscode (TAN). Dies bietet einen hohen Schutz vor Missbrauch, da der Code nur einmal verwendet werden kann und sofort ungültig wird.
Die Eingabe von Zugangsdaten wie PIN und TAN erfolgt ausschließlich auf der sicheren Zahlungsplattform von SOFORT und nicht auf der Website des Verkäufers. Dadurch wird sichergestellt, dass der Verkäufer keinen Zugriff auf sensible Informationen wie PIN und TAN hat. Die Datenübertragung erfolgt ausschließlich über hochsichere Verbindungen. SOFORT selbst speichert keine sensiblen Informationen, da SOFORT ausschließlich ein technischer Dienstleister ist.